Στρατηγικός στόχος του ΕΑΠ Αγράφων είναι η αξιοποίηση των διαθέσιμων εθνικών και ευρωπαϊκών πόρων αφενός για την προστασία των ορεινών όγκων και των φυσικών και πολιτισμικών πόρων και αφετέρου για την ενίσχυση και ανάπτυξη πολλαπλών δραστηριοτήτων
Αποτελούν ζώνη εξάπλωσης του αγριόγιδου των Βαλκανίων και του λεπιδόπτερου (Parnassius apollo) του οποίου οι πληθυσμοί περιορίζονται κατά μήκος της οροσειράς της Πίνδου και εμπίπτουν στην περιοχή εξάπλωσης της καφέ αρκούδας (Ursus arctos).